Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn8Q9Z260 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms