Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms