Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms