Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shcbp1Q9Z179 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms