Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne6Q9Z140 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms