Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp5Q9Z131 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms