Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms