Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms