Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms