Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnip1Q9WUU8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnip1Q9WUU8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms