Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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