Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF3

Casp8ap2, CASP8-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8ap2Q9WUF3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Casp8ap2Q9WUF3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms