Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FarsbQ9WUA2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms