Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skp1Q9WTX5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms