Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Usp18Q9WTV6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp18Q9WTV6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp18Q9WTV6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms