Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6cQ9WTM3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms