Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx6Q9R1R0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms