Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod2Q9R0B9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod2Q9R0B9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms