Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkab1Q9R078 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkab1Q9R078 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkab1Q9R078 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkab1Q9R078 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms