Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CtsjQ9R014 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms