Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf4Q9QZS2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms