Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Npas3Q9QZQ0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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