Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp21Q9QZL6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp21Q9QZL6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms