Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ripk3Q9QZL0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms