Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ercc4Q9QZD4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms