Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms