Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms