Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms