Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irx4Q9QY61 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms