Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Opn4Q9QXZ9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Opn4Q9QXZ9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Opn4Q9QXZ9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Opn4Q9QXZ9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Opn4Q9QXZ9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Opn4Q9QXZ9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn4Q9QXZ9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn4Q9QXZ9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn4Q9QXZ9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn4Q9QXZ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn4Q9QXZ9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Opn4Q9QXZ9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn4Q9QXZ9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn4Q9QXZ9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn4Q9QXZ9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn4Q9QXZ9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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