Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf354bQ9QXT9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf354bQ9QXT9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms