Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad18Q9QXK2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms