Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Limd1Q9QXD8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Limd1Q9QXD8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms