Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim44Q9QXA7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim44Q9QXA7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms