Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms