Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabgef1Q9JM13 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms