Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot9Q9JKY0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cnot9Q9JKY0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cnot9Q9JKY0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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