Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms