Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod2Q9JKK7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmod2Q9JKK7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms