Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms