Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp5Q9JKD3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms