Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ybx3Q9JKB3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ybx3Q9JKB3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms