Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms