Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Alyref2Q9JJW6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Alyref2Q9JJW6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Alyref2Q9JJW6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Alyref2Q9JJW6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Alyref2Q9JJW6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Alyref2Q9JJW6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Alyref2Q9JJW6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Alyref2Q9JJW6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Alyref2Q9JJW6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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