Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Caln1Q9JJG7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Caln1Q9JJG7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Caln1Q9JJG7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Caln1Q9JJG7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Caln1Q9JJG7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Caln1Q9JJG7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Caln1Q9JJG7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Caln1Q9JJG7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Caln1Q9JJG7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Caln1Q9JJG7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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