Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Riox1Q9JJF3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Riox1Q9JJF3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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