Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpf2Q9JJ80 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms