Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf2ird1Q9JI57 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf2ird1Q9JI57 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms