Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rb1cc1Q9ESK9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rb1cc1Q9ESK9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms