Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ropn1Q9ESG2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms